Как оформить возврат товара, отгруженного и оплачено до начала работы в программе для того, чтобы товар приходовался по учетной цене и выполнялось сторнирование дохода, полученный в результате продажи?

Доход сторнируется только в случае, если указан документ возврата. Поэтому для оформления подобной возвратной операции следует:

1. Ввести остатки по этим товарам при помощи документа "Ввод остатков товара".
2. Внести "Расходную накладную" на возвращаемые товары с указанием реальной цены и суммы отгрузки, а также "Банковскую выписку" с оплатой данной расходной накладной.
3. Ввести на основании "Расходной накладной" "Приходную накладную (возврат)".