Как можно создать план продаж в разрезе физических лиц, например менеджеров, а не в разрезе подразделений (создавая менеджера как подразделение)?

Для этого можно использовать свойства документа планирования.

В документе планирования нажать на пиктограмму "Свойства" и добавить новое свойство документа (из появившегося окошка выбора выбирать Документ).

Для нового свойства ввести "Наименование" - Менеджер, "Тип значений" - Справочник, "Ссылка" - Пользователи (или Физические лица, если менеджеры занесены в справочник физических лиц, что не совсем правильно, поскольку везде выбор менеджера ведется из справочника Пользователи).

В список значений нужно ввести менеджеров из списка пользователей.

Для каждого документа планирования определить в качестве свойства конкретного менеджера.

Далее в отчетах в группировке выбирать это свойство (Документ планирования - Свойство - Менеджер) и делать группировку по этому свойству. Можно также сделать отбор по этому свойству.