Під час проведення документа "Авансовий звіт" як рахунок обліку запасів використовується рахунок, зазначений у картці ТМЦ. Аналогічно, під час переміщення, продажу або списання ТМЦ як рахунок обліку також обирається рахунок, зазначений у картці ТМЦ. Заборона зміни рахунку обліку в документі призначена для зменшення кількості помилок користувачів, пов'язаних із вибором різних рахунків надходження та списання.
Використовувати суми, зазначені в документі, у розрахунках не можна, тому що вони можуть розбиватися на кілька періодів (у разі, якщо період лікарняного листа перетинає межу місяця). Тому в українських конфігураціях кожен розрахунок, що вводиться документом "Лікарняний лист", сам розраховує суму, що припадає на кожен із періодів, виходячи із суми середньої зарплати.
За інтенсивної роботи кількох користувачів на продуктивність системи може впливати значення параметра "Період опитування змін бази даних" (меню "Сервіс-Параметри-Загальні").
Якщо як кореспондуючий рахунок вказано рахунок 70, то документ "Прибутковий касовий ордер" і не повинен формувати проводки з ПДВ, вони повинні формуватися документом "Роздрібна накладна". Така можливість формування проводки з ПДВ документом "Прибутковий касовий одер" виникає лише в тому разі, якщо значення константи "Проводки по касі лише касовими ордерами" встановлено в значення "Ні", але в самому документі "Прибутковий касовий ордер" не встановлено прапорець "Лише зареєструвати". Але при цьому руйнується цілісність і логіка ведення ділянки продажу товарів у роздріб, прийнята в цій конфігурації (див. докладніше статтю "Відображення продажу в роздріб у конфігурації "Бухгалтерський облік для України"), до того ж проводки з ПДВ формуються з неправильною кореспонденцією — за дебетом рахунку 643, а не 702, як цього вимагають принципи ведення бухгалтерського обліку (виручка від реалізації товарів населенню за готівку та підприємствам і установам у відповідних продажних цінах за безготівковим розрахунком відображається за кредитом субрахунку 702 "Дохід від реалізації товарів". Сума податкових зобов'язань з ПДВ від обороту з продажу товарів (доходу) відноситься на дебет цього субрахунку. Сальдо субрахунку 702 "Дохід від реалізації товарів" показує суму чистого доходу роздрібної торгівлі).
Іноді користувачі змінюють документи, які в типовій конфігурації не формують проводок, з тим, щоб ці документи формували проводки. Наприклад, рахунки-фактури або платіжні доручення. При цьому деякі користувачі, написавши цілком правильно в модулі документа алгоритм формування проводок, стикаються з тим, що документ проводки не формує.
Зазвичай експорт проводок до бухгалтерії здійснюється один раз наприкінці місяця. Внесення операцій за касою та розрахунковим рахунком необхідно виконувати щодня. Таким чином, виплата співробітникам заробітної плати відображається в бухгалтерії безпосередньо в день виплати і, відповідно, експортувати проводки з виплати зарплати — не потрібно. В іншому разі це призведе до збільшення суми виплати.
Факт видачі заробітної плати співробітникам відображається в інформаційній системі за допомогою документа "Видатковий касовий ордер" під час вибору типу операції "Видача ЗП". Як документ-підставу необхідно вказати документ "Видача ЗП", який, своєю чергою, формує друковану форму відомості заробітної плати.