Почему по основному месту работы сотрудника, который работал на предприятии как внутренний совместитель и был уволен, не проводятся документы по начислению отпуска (больничных и т.д.)?

Оформление документов по сотруднику, который работает на предприятии по основному месту работы, но был уволен как сотрудник по внутреннему совместительству, зависит от порядка оформления документа увольнения.

При увольнении сотрудника - внутреннего совместителя, в документе "Увольнение из организации" не следует устанавливать флаг "Увольнять в упр. учете".

В этом случае документы, которые производят расчет оплаты за неотработанное время по основному месту работы сотрудника, например: "Начисление отпуска работникам организаций", "Начисление по больничному листу", будут рассчитаны и проведены корректно.